home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Software Vault: The Diamond Collection / The Diamond Collection (Software Vault)(Digital Impact).ISO / cdr16 / med9505a.zip / M9550117.TXT < prev    next >
Text File  |  1995-03-04  |  3KB  |  41 lines
  1.        Document 0117
  2.  DOCN  M9550117
  3.  TI    Local and global structural properties of the HIV-MN V3 loop.
  4.  DT    9505
  5.  AU    Catasti P; Fontenot JD; Bradbury EM; Gupta G; Theoretical Biology and
  6.        Biophysics Group, Los Alamos National; Laboratory, New Mexico 87545.
  7.  SO    J Biol Chem. 1995 Feb 3;270(5):2224-32. Unique Identifier : AIDSLINE
  8.        MED/95138191
  9.  AB    Studies of the feasibility of a subunit vaccine to protect against human
  10.        immunodeficiency virus (HIV) infection have principally focused on the
  11.        third variable (V3) loop. The principal neutralizing determinant (PND)
  12.        of HIV-1 is located inside the V3 loop of the surface envelope
  13.        glycoprotein, gp120. However, progress toward a PND-based vaccine has
  14.        been impeded by the amino acid sequence variability in the V3 loops of
  15.        different HIV isolates. Theoretical studies revealed that the
  16.        variability in sequence and structure of the V3 loop is confined to the
  17.        N- and C-terminal sides of the conserved GPG crest. This leaves three
  18.        regions of the V3 loop conserved both in sequence and secondary
  19.        structure. We present the results of NMR studies that test the validity
  20.        of our theoretical predictions. Structural studies are reported for the
  21.        HIV-V3 loop (HIV-MN) in the linear and cyclic (S-S-bridged) forms. For
  22.        the V3 loop sequence of the HIV-MN isolate, the three conserved
  23.        secondary structural elements are as underlined below: turns turn helix
  24.        CTRPNYNKRKRIHIGPGRAFYTTKNIIGTIROAHC Finally, the conformational
  25.        requirement of the PND in the V3 loop-antibody interaction is tested by
  26.        monitoring the monoclonal antibody binding to the HIV-MN V3 loop in the
  27.        linear and cyclic forms by enzyme-linked immunosorbent assay. The
  28.        binding data reveal that the cyclic V3 loop is a better ligand for the
  29.        monoclonal antibodies than the linear form although the latter has the
  30.        same sequence. This means that the monoclonal antibodies recognize the
  31.        PNDs as conformational epitopes.
  32.  DE    Amino Acid Sequence  HIV Antigens/CHEMISTRY  HIV Envelope Protein
  33.        gp120/*CHEMISTRY/IMMUNOLOGY  HIV-1/IMMUNOLOGY/*ULTRASTRUCTURE  Models,
  34.        Molecular  Molecular Sequence Data  Nuclear Magnetic Resonance  Protein
  35.        Structure, Secondary  Solvents  Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.
  36.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  37.  
  38.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  39.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  40.  
  41.